滴虫性阴道炎是要全身用药，由于滴虫阴道炎可存在于尿道、尿道旁腺、前庭腺等多个部位同时，不适合局部的用药。因此治疗的药物为硝基咪唑类的药物，如甲硝唑、替硝唑等。对于孕妇，建议使用甲硝唑的治疗还有7天治疗。若是滴虫性阴道炎是性传播，建议男性要接受治疗的。

滴虫性阴道炎一旦确诊，女性患者及其性伴侣需要使用甲硝唑并服用。药物治疗后阴道白带需要重新检查，若是三次正常说明已经治愈，而且滴虫性阴道炎预后良好不易复发，而念珠菌的性质分为菌丝还有叶状体两个阶段，丘脑期易潜伏在体内而无症状导致治疗不彻底。